Tak jak zauważyłeś PS dostosowuje wymiar w pikselach do dpi. Czcionki są mierzone w punktach, które zależą od dpi a nie pikseli.
Dobrze zobaczysz problem jak sobie wpiszesz tekst jakąś czcionką, zmienisz dpi (bez zmiany wielkości pliku w pikselach oraz zmiany wielkości czcionki) i wpiszesz coś znowu.
Musisz niestety dbać o porządek i pamiętać o ustawieniach dpi w plikach (oraz importowanych warstwach!).
Zakładki